农村卫生工作关系到保护农民健康、振兴农村经济、维护农村社会发展和稳定的大局，做好农村卫生工作是各级人民政府义不容辞的责任。随着经济发展和财政收入的增长，各级人民政府要努力增加卫生事业投入，增长幅度不低于同期经常性财政支出增长幅度，并积极调整卫生支出结构，从现在起到2010年，各级人民政府增加的卫生投入主要用于发展农村卫生事业。同时，要广泛动员社会力量筹集资金发展农村卫生事业，不断提高农民健康水平。

各级人民政府对农村卫生的财政补助范围包括：疾病控制、妇幼保健、卫生监督和健康教育等公共卫生工作，必要的医疗服务，卫生事业发展建设以及支持新型农村合作医疗制度。

根据当地服务人口、公共卫生服务量及乡（镇）公共卫生人员数量，并考虑经济发展和财力情况等因素，由县级财政合理安排公共卫生经费，纳入财政预算，保证开展公共卫生工作需要的人员经费和业务经费。

农村公共卫生经费主要实行项目管理。县级卫生部门按照国家确定的农村公共卫生服务基本项目及要求，合理确定项目实施所需人员经费和业务经费。人员经费按照工作量核定，业务经费按照开展项目工作必需的材料、仪器、药品、交通、水电消耗等成本因素核定。项目可以交由政府举办的卫生机构组织实施，也可以由政府通过招标等方式交由其他符合条件的医疗卫生机构承担。目前不具备项目管理条件的地区和不适合按项目管理的工作，可以按照定员定额和项目管理相结合的方法核定公共卫生经费。

省和市（地）级卫生部门根据工作需要，在市（地）、县（市）、乡（镇）开展公共卫生工作所需经费，由同级财政安排经费补助。省级财政承担购买全省计划免疫疫苗和相关的运输费用。

中央财政通过专项转移支付对困难地区涉及面广、危害严重的重大传染病、地方病和职业病等的预防控制项目给予补助。

村卫生室、民办卫生机构或乡村医生、个体医生承担预防保健任务所需经费，由乡（镇）卫生院等按其承担的具体任务核定。