国务院南水北调工程建设委员会办公室主要职责内设机构和人员编制规定（2003年） 协调、落实和监督南水北调工程建设资金的筹措、管理和使用；参与研究并参与协调中央有关部门和地方提出的南水北调工程基金方案和基金征收管理办法；审查并提出年度建设资金预算，经批准后组织实施；组织实施投资控制风险分析；参与南水北调工程经济运行机制和供水水价方案的研究；负责机关及直属事业单位部门预算编制、财务及资产管理工作。