国务院南水北调工程建设委员会办公室主要职责内设机构和人员编制规定（2003年） 监督控制南水北调工程投资总量，监督工程建设项目投资执行情况；汇总南水北调工程年度开工项目及投资规模并提出建议；承办南水北调工程建设和直属基础设施建设年度投资计划的编制、下达和调整的有关具体工作；协调、平衡南水北调工程投资计划和工程进度；组织开展南水北调工程建设专题研究；审查并提出工程预备费项目和中央投资结余使用计划的建议；提出因政策调整及不可预见因素增加的工程投资建议；审查年度投资价格指数和价差；组织项目建设评价工作，管理基建投资统计工作；参与工程建设期间水量调度方案的编制和水量调度。