国务院南水北调工程建设委员会办公室主要职责内设机构和人员编制规定（2003年） 组织起草南水北调工程建设有关法规草案和会议文件；组织研究、拟订南水北调工程建设有关政策和管理办法；组织实施机关有关规章制度；负责会议组织、文电管理、秘书事务、机要保密和档案管理等工作；组织南水北调工程建设有关信息、资料的收集、整理、发布和机关电子政务建设；组织南水北调工程建设的宣传，协调重大宣传活动；负责人民来信来访工作；组织协调南水北调工程建设中与外国政府机构、组织及国际组织间的合作与交流，协助有关方面为南水北调工程建设引进资金和技术；负责机关和直属单位机构编制、人事管理、工资和培训等工作；负责机关、直属单位外事和出国（境）人员的审查工作；负责机关及直属单位党风廉政建设工作；组织机关及直属单位的内部审计工作。承办机关党委的日常工作。